03TEST Enzymy

Fosfodiesteráza patří mezi:
exonukleázy
enzymy modifikující nukleové kyseliny
endonukleázy
polymerázy

Restrikční endonukleázy:
štěpí dvouřetězcové DNA
štěpí jednořetězcové RNA
štěpí jednořetězcové DNA u dvouřetězcových molekul
štěpí pouze jeden řetězec
u dvouřetězcových molekul štěpí oba řetězce
štěpí dvouřetězcové RNA
štěpí dvouřetězcové DNA-RNA-hybridní molekuly

Ligázy patří mezi:
-enzymy odbourávající nukleové kyseliny
-enzymy spojující molekuly nukleových kyselin
-enzymy modifikující nukleové kyseliny
-enzymy syntetizující nukleové kyseliny

Jednořetězcovou DNA specificky štěpí:
S1 nukleáza
Exonukleáza Bal 31
Restrikční endonukleáza EcoR I
DNáza I
DNA-polymeráza I

Jednořetězcové molekuly DNA štěpí:
exonukleáza Bal31
restrikční endonukleázy
S1 nukleáza
exonukleáza III
DNáza I

Nukleázy patří mezi:
-enzymy spojující molekuly nukleových kyselin
-enzymy odbourávající nukleové kyseliny
-enzymy modifikující nukleové kyseliny
-enzymy syntetizující nukleové kyseliny

Terminální transferáza:
syntetizuje řetězec RNA
využívá matrici DNA
nevyžaduje matricovou molekulu
syntetizuje řetězec DNA
využívá matrici RNA

Místa štěpení restrikčními endonukleázami třídy II jsou:
-zpravidla dlouhá 17 – 25 bp
-ve vzdálenosti 5-60 bp od rozpoznávané sekvence
-uvnitř rozpoznávané sekvence
-rotačně symetrická (palindrom)
-dlouhá 4 - 8 bp
-charakteru přímé repetice

Vyberte všechny ingredience a faktory, které DNA-polymeráza vyžaduje pro průběh enzymatické reakce in vitro:
promotor
molekulu mRNA
optimální pH a přítomnost určitých iontů
molekulu dvouřetězcové matricové DNA
volný konec 3' pro připojování nukleotidů (primer)
molekulu denaturované dvouřetězcové matricové DNA
NAD+
volné dNTP v prostředí

K přípravě jednosměrných delecí na DNA se používá:
exonukleáza ExoIII
Klenovův fragment DNA-polymerázy I
restrikční endonukleáza HindIII
DNA-polymeráza II
DNáza I

Ke spojení dvou fragmentů dvouřetězcové DNA s tupými konci lze použít:
-DNA ligázu kódovanou fágem T4
-DNA-polymerázu III
-DNA-ligázu z E. coli
-terminální transferázu

Uvolněná aktivita restrikčních enzymů se projevuje:
-neschopností enzymu štěpit danou sekvenci za optimálních podmínek
-štěpením téže sekvence v několika místech současně
-schopností enzymu štěpit za daných podmínek několik různých sekvencí na téže DNA

Restriktázy patří mezi:
exonukleázy
enzymy modifikující nukleové kyseliny
endonukleázy

Vlákno tvořené řetězcem RNA odstraníme u DNA-RNA hybridu pomocí:
RNázy H
RNázy A
DNázy I
Restrikční endonukleázy EcoR I
Exonukleázy Bal 31
S1 nukleázy

Polymerázy patří mezi:
-enzymy spojující molekuly nukleových kyselin
-enzymy odbourávající nukleové kyseliny
-enzymy syntetizující nukleové kyseliny
-enzymy modifikující nukleové kyseliny

Jaké konce vzniknou po štěpení restrikční endonukleázou? Svislá čára znázorňuje místo štěpení na každém z řetězců.
5' G A|A T T C 3'
3' C T T A|A G 5':

-3'-přečnívající
-5'-přečnívající
-zarovnané (tupé)

Současný známý počet restrikčních endonukleáz je ...

Klenowův fragment DNA-polymerázy I je:
-část molekuly restriktázy EcoRI vyznačující se relaxovanou specifitou
-část molekuly DNA-polymerázy I postrádající 5´- 3´ exonukleázovou aktivitu
-část molekuly DNA-polymerázy I postrádající obě exonukleázové aktivity
-část molekuly DNA-polymerázy I postrádající 3´- 5´exonukleázovou aktivitu

Jaké konce vzniknou po štěpení restrikční endonukleázou? Svislá čára znázorňuje místo štěpení na každém z řetězců.
5' G A A T T|C 3'
3' C|T T A A G 5':

-3'-přečnívající
-5'-přečnívající
-zarovnané (tupé)

Restrikční endonukleáza HaeIII byla izolována z mikroorganismu:
-H. aegypticus, kmene ATCC 111116
-Escherichia coli, kmene HAEIII
-Haemophilus influenzae, kmene E III

DNázaI patří mezi:
polymerázy
enzymy modifikující nukleové kyseliny
exonukleázy
endonukleázy

Zpětná transkriptáza patří mezi:
exonukleázy
enzymy modifikující nukleové kyseliny
polymerázy
endonukleázy

Dvouřetězcové molekuly DNA štěpí:
restrikční endonukleázy
S1 nukleáza
exonukleáza III
exonukleáza Bal31
DNáza I

Jaké konce vzniknou po štěpení restrikční endonukleázou? Svislá čára znázorňuje místo štěpení na každém z řetězců.
5' G A A|T T C 3'
3' C T T|A A G 5':

5'-přečnívající
zarovnané (tupé)
3'-přečnívající

DNA-metylázy patří mezi:
enzymy syntetizující nukleové kyseliny
enzymy odbourávající nukleové kyseliny
enzymy modifikující nukleové kyseliny
enzymy spojující molekuly nukleových kyselin

Zpětná transkriptáza:
-syntetizuje řetězec DNA
-využívá matrici DNA
-syntetizuje řetězec RNA
-využívá matrici RNA
-nevyžaduje matricovou molekulu

Fosfát z 5'-konce DNA odštěpíme:
EcoRI-defosforylázou
dam-metylázou
T4-polynukleotid kinázou
CIP-fosfatázou
T4 DNA-ligázou

Fosfatáza patří mezi:
exonukleázy
enzymy modifikující nukleové kyseliny
endonukleázy

Restrikční endonukleáza HincII byla izolována z mikroorganismu
Haemophilus aegypticus, kmene C II
Haemophilus influenzae, kmene ATCC 12516
Escherichia coli, kmene HINCII

Izoschizomery jsou:
-různé restrikční enzymy, které mají stejné cílové sekvence
-různé restrikční enzymy, které jsou izolovány ze stejného producenta
-různé restrikční enzymy, které rozeznávají odlišné cílové sekvence, ale vytvářejí stejné kohezní konce

Pro zatupení 3´-přečnívajícího konce DNA lze použít:
Nukleázu S1
Exonukleázu III
Klenowův enzym

K enzymům, které syntetizují NK in vitro bez matrice patří:
DNA-polymeráza III
terminální transferáza
terminální DNA polymeráza
Klenowův fragment

Do kolika tříd se restrikční endonukeázy rozdělují?

Jaké konce vzniknou po štěpení restrikční endonukleázou? Svislá čára znázorňuje místo štěpení na každém z řetězců.
5' G A A T T|C 3'
3' C|T T A A G 5':

zarovnané (tupé)
3'-přečnívající
5'-přečnívající

Lysozym se používá pro:
degradaci proteinů
odstranění buněčné stěny u bakterií
odstranění RNA

Poly(A)-polymeráza:
-využívá matrici DNA
-syntetizuje řetězec DNA
-nevyžaduje matricovou molekulu
-syntetizuje řetězec RNA
-využívá matrici RNA

polynukleotid kináza patří mezi:
polymerázy
endonukleázy
exonukleázy
enzymy modifikující NK

K enzymům které syntetizují NK in vitro bez matrice patří:
terminální DNA polymeráza
terminální transferáza
Klenowův fragment
DNA-polymeráza III