09 Buněčná smrt

  1. Neprogramovaná x Programovaná buněčná smrt?
    • Programovaná
    • zprostředkovaná specifickým buněčným signálním systémem
    • prospěšná pro organismus, jehož je umírající buňka součástí
    • Neprogramovaná
    • nastává neregulovaně z vnějších příčin (insult)

    • každý den v našem těle odumře 50-70 miliard buněk
    • složení těla se obměňuje
    • zdravá buňka je vždy připravena zemřít, sebedestrukční mechanismus se spustí pouhou absencí signálů „pro-survival“
  2. vyjmenuj + definuj typy bun. smrti
    apoptóza
    autofagie
    excitotoxicita
    anoikis
    nekróza
    nekroptóza
    • apoptóza (zprostředkovaná kaspázami během vývoje, stárnutí nebo jako odezva na specifické podněty)
    • autofagie (rozklad buněčných složek v lysozomech)
    • excitotoxicita (smrt nervových buněk v důsledku přílišné aktivace receptorů pro nervové přenašeče)
    • anoikis (důsledek poruchy interakcí, které buňku ukotvují v matrix)
    • nekróza (indukovaná nespecifickým traumatem)
    • nekroptóza (programovaná forma nekrózy, závislá na aktivitě specifických kináz RIP, bez dominantní účasti kaspáz)
  3. co víš o apoptóze?
    • fyziologický proces odumírání buňky
    • popsána u živočichů i rostlin
    • probíhá řízeně podle speciálního programu
    • destrukci buňky zajišťují speciální enzymy - kaspázy
    • výsledkem je rychlá fragmentace a fagocytóza buňky
    • nástroj udržování homeostáze

    • Proč?
    • stresové podněty z okolního prostředí
    • nevratné poškození DNA
    • vývojové procesy
    • reakce na viry/patogeny

    • význam:
    • protiváha nadměrné proliferace buněk
    • podíl na formování a tvarování orgánů a tkání („sculpting“)
    • eliminace přestárlých buněk
    • eliminace poškozených n. geneticky aberantních buněk (neopravitelné poškození DNA, extrémní kyslíková deprivace, významná signální nerovnováha, apod.)

    • název z řečtiny (opadávání květů nebo listů)
    • provázena charakteristickými morfologickými změnami

    • Apoptóza a formování tkání
    • apoptózou jsou během morfogeneze odstraňovány nežádoucí buňky – tvorba funkčních a řádně tvarovaných tkání a orgánů
    • spolu s migrací, proliferací a diferenciací buněk jde o klíčový proces doprovázející vývoj organismů
    • geneticky pozměněné myši, které postrádají klíčové složky apoptotického aparátu vykazují vývojové poruchy- nadbytek neuronů v mozku, obličejové abnormality, poruchy formování prstů, atd.
  4. popiš Morfologické projevy apoptózy
    • zmenšování buněk
    • kondenzace a fragmentace jádra
    • řízená fragmentace chromozomální DNA
    • v konečné fázi se fragmentuje celá buňka do malých kompaktních tělísek, které podléhají fagocytóze
    • nedojde ke vzniku zánětu

    Image Upload 2
  5. popiš Nežádoucí projevy apoptózy
    • nadbytek i nedostatek apoptózy je nežádoucí
    • přílišná apoptóza poškozuje tkáně (degenerativní procesy)
    • nedostatečná apoptóza buňky predisponuje k hromadění genetických poruch a tvorbě nádorů
    • změny v apoptóze zaznamenány u autoimunitních chorob, AIDS, rakoviny, neurodegenerativních chorob (Huntington, Alzheimer), mrtvice, infarktu
    • snahy indukovat apoptózu u nádorových buněk
    • snahy redukovat apoptózu v případě odumírání mozkových buněk po mrtvici
  6. apoptóza a formování tkání u člověka
    Vývoj končetiny: buňky odumírají v prostoru mezi formujícími se prsty

    Image Upload 4

    Image Upload 6

    • a u žáby:)
    • Image Upload 8

    Image Upload 10
  7. Apoptóza versus nekróza
    • Image Upload 12
    • Apoptóza
    •  aktivní proces
    •  přesný harmonogram
    •  kondenzace chromatinu
    •  rozpad jádra
    •  odbourání cytoskeletu („zhroucení“ buňky)
    •  fragmentace chromozomální DNA
    •  mitochondrie dlouho intaktní
    •  výběžky buněčné membrány
    •  fagocytóza pozůstatků buňky

    • Nekróza
    •  pasivní smrt
    •  postihuje skupiny buněk
    •  vyvolaná neléčitelným zraněním (nedostatek kyslíku, extrémní teploty, mechanické poškození, atd.)
    •  poškození mitochondrií - vyčerpání ATP
    •  poškozenou membránou proniká do buňky voda, buňka se zvětšuje
    •  zvětšují se organely
    •  celková dezintegrace
    •  uvolnění nitrobuněčných komponent
    •  vznik zánětu

    Image Upload 14
  8. popiš Signály indukující apoptózu
    • vnitřní
    • ze samotné buňky podléhající apoptóze
    • poškození DNA, virová infekce, exprese onkogenů

    • vnější
    • z okolních buněk organismu nebo vnějšího prostředí
    • nedostatek vyživovacích signály (absence signálů „pro-survival“)
    • přítomnost signálů indukujících apoptózu („pro-death“)
  9. apoptóza má dvě fáze:
    fáze latentní následovaná fází exekuční
  10. popiš Latentní fázi apoptózy
    • normální vzhled a fungování buněk
    • podfáze „odsouzení“ – buňka je na dráze směřující k smrti, ale může být zachráněna anti-apoptotickými faktory
    • podfáze „rozhodnutí“ - buňka již nevyhnutelně směřuje k exekuční fázi
    • trvání latentní fáze je variabilní

    Image Upload 16
  11. popiš exekuční fázi apoptózy
    • zahájení morfologických a fyziologických změn
    • trvání této fáze je velmi rychlé ve srovnání s latentní fází (do 1 hod)
    • konzervativní průběh
    • Image Upload 18
  12. který transkripční faktor řídí osud buňky?
    • p53
    • možnosti:
    •  indukce apoptózy
    •  zastavení buněčného cyklu
    •  zahájení opravy DNA
    •  diferenciace buněk
    • účinky dány jeho schopností měnit expresi svých cílových genů
  13. v nepoškozené buňce je hladina p53 nízká v důsledku ...
    • v důsledku řízené vlastní degradace:
    • p53 aktivuje expresi ubikvitin ligázy Mdm2
    • Mdm2 připojí ubikvitin k p53
    • p53 s kovalentně připojeným řetězcem ubikvitinů je degradován v proteazomu
  14. v buňce vystavené stresu se p53 ... a začne aktivovat expresi jiných genů (např. zapojených do kontroly buněčného cyklu a apoptózy)
    fosforyluje

    Image Upload 20

    bez aktivace mdm2 se p53 stabilizuje a jeho hladina v buňce rychle stoupá
  15. na jaké typy stresu reaguje p53?
    • negenotoxické
    • nedostatek růstových faktorů
    • nedostatek ribonukleotidů
    • přítomnost určitých cytokinů

    • genotoxické
    • poškození DNA
    • záření
    • oxidativní stres
  16. na kterém modelu studujeme apoptózu?
    • identifikace klíčových regulátorů
    • využití modelu hlístice Caenorhabditis elegans (Háďátko obecné)
  17. pomocí speciální optiky (...) lze mikroskopií sledovat každoubuňku vyvíjejícího se těla C. elegans
    Nomarski

    • sestavení mapy původu každé jednotlivé buňky a sledování její historie až k oplozenému vajíčku
    • z 1090 somatických buněk vytvořených během embryogeneze 131 buněk odumírá to místně a časově specificky
    • identifikováno 14 genů ovlivňujících programovanou buněčnou smrt
    • Nobelova cena 2002
    • Robert Horvitz, John Sulston, Sydney Brenner
  18. V apoptotické signalizaci se uplatňují tři skupiny proteinů, které?
    •  regulátory
    •  adaptéry
    •  efektory

    • Image Upload 22
    • ced = cell death abnormal mutants

    • ced-3 a ced-4 jsou pro-apoptotické
    • ced-9 blokuje funkci genů ced-3 a ced-4 (je anti-apoptotický)
  19. Ced-3 patří do rodiny proteáz, zvaných ...
    kaspázy
  20. definuj kaspázy
    • kaspázy jsou klíčovými výkonnými účastníky apoptózy
    • cysteinyl aspartát-specifické proteázy
    • ↦ cystein je přítomen v aktivním místě enzymu
    • ↣ kyselina asparagová je přítomna v cílovém místě štěpeného substrátu 

    • Image Upload 24
    • syntetizovány jako inaktivní zymogeny – prokaspázy, které se aktivují odštěpením inhibiční prodomény

    • po aktivaci degradují klíčové buněčné struktury
    • uplatňují se jako iniciátory i efektory apoptózy
    • Image Upload 26

    • v aktivní formě složené ze 2 velkých a 2 malých podjednotek
    • inaktivní zymogeny obsahují N-koncovou pro-doménu, za kterou následuje velká a malá doména
    • mezi doménami jsou aspartátové zbytky, tj. cíle kaspázového aktivačního štěpení, po kterém vzniká velká a malá podjednotka,  které spolu heterodimerizují
    • Image Upload 28
  21. Ced-4 se podílí na aktivaci kaspáz - jeho savčím protějškem je ...
    • Apaf-1
    • („apoptotic protease-activating factor 1“)
  22. Ced-9 patří do rodiny ... regulátorů buněčné smrti
    • Bcl-2
    • Image Upload 30
  23. charakterizuj rodinu Bcl-2
    • pro- nebo anti-apoptotická funkce
    • lidský gen rodiny bcl-2 může funkčně nahradit chybějící gen ced-9 u C. elegans
    • obsahuje strukturně příbuzné proteiny s doménou BH (BCL-homology)
    • doména BH je potřebná pro meziproteinové interakce proteinů Bcl-2

    Image Upload 32

    • regulátory apoptózy mohou být nebezpečné
    • název bcl-2 odráží souvislost s lymfomy B-buněk (B-cell lymphoma)
    • tento typ rakoviny vzniká v důsledku translokace t(14;18), díky které se gen bcl-2 dostává do intenzivně přepisované oblasti genu kódujícího těžký řetězec imunoglobulinů- hladina Bcl-2 v těchto buňkách proto stoupá, což je důležitým faktorem nádorové transformace
    • bcl-2 je možné považovat za onkogen, který ale neindukuje proliferaci buněk, ale narušuje rovnováhu mezi životem a smrtí buněk
    • buňky s vysokou expresí bcl-2 jsou odolné k induktorům smrti
  24. regulátory apoptózy mohou být nebezpečné 
    název bcl-2 odráží souvislost s lymfomy B-buněk (B-cell lymphoma) 
    tento typ rakoviny vzniká v důsledku ...
    • translokace t(14;18),
    • díky které se gen bcl-2 dostává do intenzivně přepisované oblasti genu kódujícího těžký řetězec imunoglobulinů- hladina Bcl-2 v těchto buňkách proto stoupá, což je důležitým faktorem nádorové transformace 
    • bcl-2 je možné považovat za onkogen, který ale neindukuje proliferaci buněk, ale narušuje rovnováhu mezi životem a smrtí buněk 
    • buňky s vysokou expresí bcl-2 jsou odolné k induktorům smrti
  25. jak dělíme Kaspázy?
    • dosud známo 13 členů rodiny kaspáz, které se dělí na iniciační, exekuční a zánětové
    • zánětové kaspázy nemají souvislost s apoptózou, ale indukcí zánětlivé reakce
    • (produkcí cytokinů, apod.)

    Image Upload 34
  26. Kaspázy jsou v aktivní formě složené ze ...
    • 2 velkých a 2 malých podjednotek
    • inaktivní zymogeny obsahují N-koncovou pro-doménu, za kterou následuje velká a malá doména
    • mezi doménami jsou aspartátové zbytky, tj. cíle kaspázového aktivačního štěpení, po kterém vzniká velká a malá podjednotka, které spolu heterodimerizují
    • Image Upload 36
  27. jaké Iniciační kaspázy znáš?
    kaspázy 2, 8, 9, 10
  28. charakterizuj Iniciační kaspázy
    • obsahují velkou pro-doménu na
    • N-konci zajišťující interakci s jinými proteiny
    • fungují jako iniciátory procesů buněčné smrti – aktivují exekuční kaspázy
    • v inaktivní formě mají podobu monomerů
    • při aktivaci jsou adaptérovými molekulami převedeny do podoby dimerů
    • Image Upload 38
    • Image Upload 40
    • Image Upload 42
  29. při aktivaci jsou  iniciační kapsázy adaptérovými molekulami převedeny do podoby
    dimerů
  30. vyjmenuj Exekuční kaspázy
    kaspázy 3, 6, 7
  31. charakterizuj Exekuční kaspázy
    • obsahují malou pro-doménu na N-konci
    • aktivují se štěpením iniciačními kaspázami, následkem je zpřístupnění aktivního místa
    • nejsou schopné autoaktivace
    • štěpí různé substráty, které přímo způsobují
    • morfologické a biochemické změny v buňkách
    • Image Upload 44
  32. definuj Cíle kaspázového štěpení
    • kaspázy jsou selektivní enzymy, štěpí jen omezené spektrum jaderných a cytoplazmatických proteinů
    • štěpeno je několik strukturních proteinů a mnoho proteinů zapojených do buněčných signalizací (např. kináz)
    • kinázy mají často autoregulační domény, díky kterým se zapínají nebo vypínají podle potřeby; tyto domény jsou kaspázami odstraněny- výsledkem jsou konstitutivně aktivní/inaktivní kinázy, které aktivují pro-apoptotické procesy
  33. vyjmenuj Substráty exekučních kaspáz
    • FAK (focal adhesion kinase): kináza nutná pro adhezi buněk k matrix nebo okolním buňkám (ztráta aktivity při apoptóze)
    • laminin na vnitřním povrchu jaderné membrány (kondenzace chromatinu a pyknóza jádra)
    • aktin, plektin, vimentin, gelsolin (intermediární filamenta): kolaps cytoskeletu a tvorba vychlípenin plazmatické membrány- tvorba apoptotických tělísek
    • inhibitor kaspázou-aktivované DNAázy (ICAD) uvolňuje DNázu CAD (caspase-activated DNase), která pak fragmentuje DNA
  34. popiš funkce kaspázy 3
    • efektor apoptotické signalizace
    • štěpí různé buněčné proteiny
    • aktivuje specifickou DNázu (CAD – „caspase-activated DNase“)
    • v buňkách je CAD v komplexu se svým inhibitorem ICAD
    • kaspáza 3 v apoptotických buňkách štěpí ICAD a umožňuje tak CAD štěpit DNA mezi nukleozomy

    Image Upload 46
  35. Jak jsou kaspázy aktivovány?
    • specifickými induktory:
    • vnitřními podněty: abnormalitami ve struktu
    • ře DNA
    • vnějšími podněty: absencí růstových faktorů, přítomností specifických cytokinů (TNF, ligand Fas)

    • apoptózovými signálními drahami:
    • vnitřní dráhou závislou na mitochondriích
    • vnější dráhou nezávislou na mitochondriích
Author
iren
ID
347025
Card Set
09 Buněčná smrt
Description
molekularni biologie
Updated