-
které děje tvoří obecně iniciaci translace?
všechny děje, které zajišťují sestavení ribozomu a připojení iniciační tRNA na mRNA
-
které molekuly se zapojují do iniciace translace u prokaryot?
- 1. ribozom
- 2. iniciátorová tRNA
- 3. mRNA
- 4. tři rozpustné iniciační faktory IF-1, IF-2, IF-3
- 5. jedna molekula GTP
-
při Iniciaci translace u prokaryot dochází k tvorbě 2 komplexů:
- 1. malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3: (interakce Shineovy-Dalgarnovy sekvence s 16S rRNA)
- 2. iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2: nese antikodón k iniciačnímu kodónu AUG a metionin, jehož aminoskupina je blokována formylovou skupinou
- oba komplexy se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex
-
jak dojde ke vzniku 30s iniciačního komplexu?
oba komplexy (malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3 a iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2) se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex
-
jen si přečti:) JEDNOTLIVÉ KROKY Iniciace translace u prokaryot
- 1. Tvorba 2 komplexů:
- malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3 (interakce Shineovy-Dalgarnovy sekvence s 16S rRNA)
- iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2 nese antikodón k iniciačnímu kodónu AUG a metionin, jehož aminoskupina je blokována formylovou skupinou
- 2. oba komplexy se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex
- 3. po uvolnění IF-3 se k iniciačnímu komplexu připojuje velká podjednotka
- 4. vzniká ribozom 70S s metionyl-tRNAfMet připojenou přímo do místa P
- 5. štěpí se GTP a uvolňují IF
-
-
charakterizuj Elongaci translace u prokaryot
- Elongace zahrnuje všechny reakce od dokončení první peptidové vazby po přidání poslední aminokyseliny; ribozom se pohybuje po mRNA a každý kodón využije k translaci
-
charakterizuj terminaci translace u prokaryot
Terminace zajišťuje rozeznání terminačního kodónu ribozomem a uvolňovacím faktorem, odštěpení dokončeného polypeptidu od poslední peptidyl-tRNA a disociaci ribozomu z mRNA
-
co je Shineova-Dalgarnova sekvence?
= vazebné místo pro ribozomy na prokaryotické mRNA, definuje začátek translace
-
kde se nachází Shineova-Dalgarnova sekvence ?
umístěna 7 nukleotidů proti směru translace od iniciačního kodonu AUG
-
Shineova-Dalgarnova sekvence je komplementární k jaké sekvenci?
- je komplementární sekvenci 3´-konce 16S rRNA
- párování bází mezi SD sekvencí a 16S rRNA je podmínkou translace u prokaryot
-
Která fáze je terčem antibiotik?
replikace-transkripce-translace
translace
-
iniciace translace u eukaryot je složitější protože je do ní zapojeno několik rozpustných...
iniciačních faktorů
-
Iniciace translace u eukaryot začíná...
neformylovaným iniciačním metioninem
-
iniciační aminoacyl-tRNA (tRNAiMet) je jiná než tRNA používaná pro vnitřní metioninové kodóny; iniciační komplex se tvoří na ...
5’-konci mRNA modifikované čepičkou (ne v oblasti Shine-Dalgarno/AUG)
-
jaký protein se váže na čepičku?
protein CBP (cap-binding protein) se váže na čepičku na 5´-konci mRNA
-
jaká je fce CBP?
po dokončení syntézy a sestřihu mRNA se CBP podílí na translokaci do cytoplazmy
-
jednotlivé kroky při iniciaci translace eukaryot - jen se podívej:)
- začíná neformylovaným iniciačním metioninem
- iniciační aminoacyl-tRNA (tRNAiMet) je jiná než tRNA používaná pro vnitřní metioninové kodóny
- iniciační komplex se tvoří na 5’-konci mRNA modifikované čepičkou (ne v oblasti Shine-Dalgarno/AUG)
-
popiš Iniciaci translace u eukaryot: skenovací model navržen Marilyn Kozakovou (přečti si:)
- 1. zde je CBP nahrazen iniciačními faktory
- 2. vazba malé podjednotky 40S ribozomu s metionyl-tRNAiMet k 5´konci mRNA s čepičkou
- 3. komplex se pohybuje ve směru 5´- 3´po mRNA a hledá iniciační kodón AUG
- 4. v místě AUG: iniciační faktory se odpoutají, připojuje se velká podjednotka 60S
- 5. metionyl-tRNAiMet je připojena přímo do místa P
- 6. vzniká iniciační komplex
-
Iniciace translace u eukaryot- skenovací model navržen Marilyn Kozakovou: vazba malé podjednotky 40S ribozomu s
s metionyl-tRNAiMet k 5´konci mRNA s čepičkou
-
Iniciace translace u eukaryot- skenovací model navržen Marilyn Kozakovou: v místě AUG: iniciační faktory se odpoutají, připojuje se...
velká podjednotka 60S
-
Iniciace translace u eukaryot- skenovací model navržen Marilyn Kozakovou: metionyl-tRNAiMet je připojena přímo do místa
do místa P
-
v čem spočívá Elongace translace u eukaryot?
- postupné připojování aminokyselin k rostoucímu polypeptidu
- probíhá obdobně jako u prokaryot
-
-
kdy nastává Terminace translace ?
- 1. nastává v okamžiku, kdy do místa A vstoupí terminační kodón (stop kodón): UAA, UAG nebo UGA2. zároveň se do místa A váže uvolňovací faktor 3. ke karboxylovému konci vzniklého polypeptidu se naváže molekula vody, což vede k terminaci
-
charakterizuj uvolňovací faktory
- ↣ stop kodóny jsou rozeznány uvolňovacími faktory (RF)
- ↣ k terminačnímu kodonu v místě A se váže RF
- ↣ RF mění aktivitu peptidyltransferázy: přidává molekulu vody k C-konci
- ↣ uvolnění polypeptidu z tRNA v místě P, translokace prázdné tRNA do místa E
- ↣ uvolnění mRNA z ribozomu disociace podjednotek ribozomu
-
GENETICKÝ KÓD určuje
- určuje typ aminokyseliny, iniciaci a terminaci translace
- = tripletový nepřekrývající charakter
-
vyjmenuj Vlastnosti genetického kódu
- 1. složen z tripletů nukleotidů
- 2. triplety se nepřekrývají
- 3. neobsahuje interpunkční znaménka
- 4. je degenerovaný
- 5. obsahuje kodóny pro začátek a konec translace
- 6. je téměř univerzální
-
kdy a kým byl rozluštěn genetický kód?
Pomocí bezbuněčného systému odvozeného z E. coli prováděli translaci s využitím přirozených a syntetických mRNA o definovaných sekvencích a následně určili sekvence vytvořených peptidů
-
genetický kód je tripletový, které mutace mění jeho čtecí rámec a která jej navrátí?
Inzerce/delece jednoho/dvou páru bází mění čtecí rámec
- Supresorová mutace obnovuje původní čtecí rámec
-
Inserce/delece 3 párů bází čtecí rámec ne/mění?
nemění
-
některé mutace v genech pro tRNA mění strukturu antikodónů a proto vedou k chybné interpretaci kodónů v mRNA
tyto mutace byly původně nalezeny jako ..., které potlačovaly účinek jiných mutací
supresorové mutace
příklad: mutace tRNA, které suprimují mutace amber způsobující terminaci řetězce v UAG
-
některé supresorové mutace mění antikodóny tRNA tak, že mutantní tRNA reagují na terminační kodóny; na místo terminace translace tak dochází k...
začleňování aminokyselin do polypeptidů
-
vyjmenuj Iniciační a terminační kodony:
- - iniciační: AUG
- - terminační: UAA, UAG, UGA
- téměř univerzální (výjimky- mitochondrie a někteří prvoci)
-
-
čím je určena každá z 20AK v proteinech?
je určena jedním nebo několika nukleotidovými triplety v mRNA
-
kód je nepřekrývající (každý nukleotid patří k jedinému kodónu), degenerovaný, tz. že ...
- většina AK je určena 2-4 kodóny
|
|
