05b TRANSLACE faze

  1. které děje tvoří obecně iniciaci translace?
    všechny děje, které zajišťují sestavení ribozomu a připojení iniciační tRNA na mRNA
  2. které molekuly se zapojují do iniciace translace u prokaryot?
    • 1. ribozom 
    • 2. iniciátorová tRNA 
    • 3. mRNA 
    • 4. tři rozpustné iniciační faktory IF-1, IF-2, IF-3 
    • 5. jedna molekula GTP
  3. při Iniciaci translace u prokaryot dochází k tvorbě 2 komplexů:
    • 1. malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3: (interakce Shineovy-Dalgarnovy sekvence s 16S rRNA)
    • 2. iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2: nese antikodón k iniciačnímu kodónu AUG a metionin, jehož aminoskupina je blokována formylovou skupinou
    • oba komplexy se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex

    Image Upload 1
  4. jak dojde ke vzniku 30s iniciačního komplexu?
    oba komplexy (malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2) se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex
  5. jen si přečti:) JEDNOTLIVÉ KROKY Iniciace translace u prokaryot
    • 1. Tvorba 2 komplexů: 
    • malá podjednotka se váže na mRNA + IF-3 (interakce Shineovy-Dalgarnovy sekvence s 16S rRNA)
    • iniciační metionyl-tRNAfMet + IF-2 nese antikodón k iniciačnímu kodónu AUG a metionin, jehož aminoskupina je blokována formylovou skupinou
    • 2. oba komplexy se spojují, připojují se IF-1 a GTP: vzniká 30S iniciační komplex
    • 3. po uvolnění IF-3 se k iniciačnímu komplexu připojuje velká podjednotka
    • 4. vzniká ribozom 70S s metionyl-tRNAfMet připojenou přímo do místa P
    • 5. štěpí se GTP a uvolňují IF
    • Image Upload 2

    Image Upload 3
  6. charakterizuj Elongaci translace u prokaryot
    • Elongace zahrnuje všechny reakce od dokončení první peptidové vazby po přidání poslední aminokyseliny; ribozom se pohybuje po mRNA a každý kodón využije k translaci
    • Image Upload 4
  7. charakterizuj terminaci translace u prokaryot
    Terminace zajišťuje rozeznání terminačního kodónu ribozomem a uvolňovacím faktorem, odštěpení dokončeného polypeptidu od poslední peptidyl-tRNA a disociaci ribozomu z mRNA

     Image Upload 5
  8. co je Shineova-Dalgarnova sekvence?
    = vazebné místo pro ribozomy na prokaryotické mRNA, definuje začátek translace
  9. kde se nachází Shineova-Dalgarnova sekvence ?
    umístěna 7 nukleotidů proti směru translace od iniciačního kodonu AUG
  10. Shineova-Dalgarnova sekvence je komplementární k jaké sekvenci?
    • je komplementární sekvenci 3´-konce 16S rRNA
    • párování bází mezi SD sekvencí a 16S rRNA je podmínkou translace u prokaryot

    Image Upload 6
  11. Která fáze je terčem antibiotik?
    replikace-transkripce-translace
    translace

    Image Upload 7
  12. iniciace translace u eukaryot je složitější protože je do ní zapojeno několik rozpustných...
    iniciačních faktorů
  13. Iniciace translace u eukaryot začíná...
    neformylovaným iniciačním metioninem
  14. iniciační aminoacyl-tRNA (tRNAiMet) je jiná než tRNA používaná pro vnitřní metioninové kodóny; iniciační komplex se tvoří na ...
    5’-konci mRNA modifikované čepičkou (ne v oblasti Shine-Dalgarno/AUG)
  15. jaký protein se váže na čepičku?
    protein CBP (cap-binding protein) se váže na čepičku na 5´-konci mRNA
  16. jaká je fce CBP?
    po dokončení syntézy a sestřihu mRNA se CBP podílí na translokaci do cytoplazmy
  17. jednotlivé kroky při iniciaci translace eukaryot - jen se podívej:)
    • začíná neformylovaným iniciačním metioninem
    • iniciační aminoacyl-tRNA (tRNAiMet) je jiná než tRNA používaná pro vnitřní metioninové kodóny
    • iniciační komplex se tvoří na 5’-konci mRNA modifikované čepičkou (ne v oblasti Shine-Dalgarno/AUG)

    Image Upload 8
  18. popiš Iniciaci translace u eukaryot: skenovací model  navržen Marilyn Kozakovou (přečti si:)
    • 1. zde je CBP nahrazen iniciačními faktory
    • 2. vazba malé podjednotky 40S ribozomu s metionyl-tRNAiMet k 5´konci mRNA s čepičkou
    • 3. komplex se pohybuje ve směru 5´- 3´po mRNA a hledá iniciační kodón AUG
    • 4. v místě AUG: iniciační faktory se odpoutají, připojuje se velká podjednotka 60S
    • 5. metionyl-tRNAiMet je připojena přímo do místa P
    • 6. vzniká iniciační komplex

    Image Upload 9
  19. Iniciace translace u eukaryot- skenovací model  navržen Marilyn Kozakovou: vazba malé podjednotky 40S ribozomu s
    s metionyl-tRNAiMet k 5´konci mRNA s čepičkou
  20. Iniciace translace u eukaryot- skenovací model  navržen Marilyn Kozakovou: v místě AUG: iniciační faktory se odpoutají, připojuje se...
    velká podjednotka 60S
  21. Iniciace translace u eukaryot- skenovací model  navržen Marilyn Kozakovou: metionyl-tRNAiMet je připojena přímo do místa
    do místa P
  22. v čem spočívá Elongace translace  u eukaryot?
    • postupné připojování aminokyselin k rostoucímu polypeptidu 
    • probíhá obdobně jako u prokaryot
  23. jaký je sled událostí při elongaci translace u eukaryot?
    • 1. vazba aminoacyl-tRNA do místa A ribozomu
    • 2. přenos syntetizovaného peptidu z tRNA v místě P na tRNA v místě A vytvořením nové peptidové vazby
    • 3. posun ribozomu po mRNA, vedoucí k umístění dalšího kodónu do místa A
    • 4. současný posun tRNA nesoucí vznikající polypeptid z místa A do místa P
    • 5. přesun "prázdné" tRNA z místa P do místa E
    • 6. aminoacyl-tRNA se váže k místu A
    • antikodón aminoacyl-tRNA se musí párovat s kodónem mRNA v místě A
    • nutná přítomnost elongačního faktoru EF-Tu a GTP
    • po hydrolýze GTP na GDP se EF-Tu uvolňuje
    • 7. tvorba peptidové vazby mezi NH2-skupinou aminoacyltRNA v místě A a COOH skupinou rostoucího polypeptidového řetězce připojeného k tRNA v místě P
    • 8. řetězec se tím připojí k tRNA v místě A
    • katalyzováno peptidyltransferázovou akti-vitou velké podjednotky (současná hydrolýza GTP)
    • 9. Ribozom se po mRNA posune o jeden kodón směrem k 3´-konci:
    • ↣ peptidyl-tRNA se přesunuje z místa A do místa P
    • ↣ prázdná tRNA se přesunuje z místa P do místa E  
    • nutná přítomnost EF-G a energie hydrolýzy GTP
    • místo A je prázdné a připraveno pro příjem další aminoacyl-tRNA

    Image Upload 10

    Image Upload 11

    Image Upload 12

    Image Upload 13
  24. kdy nastává Terminace translace ?
    • 1. nastává v okamžiku, kdy do místa A vstoupí terminační kodón (stop kodón): UAA, UAG nebo UGA
    • 2. zároveň se do místa A váže uvolňovací faktor
    • 3. ke karboxylovému konci vzniklého polypeptidu se naváže molekula vody, což vede k terminaci
  25. charakterizuj uvolňovací faktory
    • ↣ stop kodóny jsou rozeznány uvolňovacími faktory (RF
    • ↣ k terminačnímu kodonu v místě A se váže RF 
    • ↣ RF mění aktivitu peptidyltransferázy: přidává molekulu vody k C-konci 
    • uvolnění polypeptidu z tRNA v místě P, translokace prázdné tRNA do místa E
    • ↣ uvolnění mRNA z ribozomu disociace podjednotek ribozomu

    • Image Upload 14
    • Image Upload 15
  26. GENETICKÝ KÓD určuje
    • určuje typ aminokyseliny, iniciaci a terminaci translace
    • = tripletový nepřekrývající charakter
  27. vyjmenuj Vlastnosti genetického kódu
    • 1. složen z tripletů nukleotidů
    • 2. triplety se nepřekrývají
    • 3. neobsahuje interpunkční znaménka
    • 4. je degenerovaný
    • 5. obsahuje kodóny pro začátek a konec translace
    • 6. je téměř univerzální
  28. kdy a kým byl rozluštěn genetický kód?
    Pomocí bezbuněčného systému odvozeného z E. coli prováděli translaci s využitím přirozených a syntetických mRNA o definovaných sekvencích a následně určili sekvence vytvořených peptidů

    Image Upload 16
  29. genetický kód je tripletový, které mutace mění jeho čtecí rámec a která jej navrátí?
    Inzerce/delece jednoho/dvou páru bází mění čtecí rámec

    Image Upload 17

    • Supresorová mutace obnovuje původní čtecí rámec
    • Image Upload 18
  30. Inserce/delece 3 párů bází čtecí rámec ne/mění?
    nemění

    Image Upload 19
  31. některé mutace v genech pro tRNA mění strukturu antikodónů a proto vedou k chybné interpretaci kodónů v mRNA
    tyto mutace byly původně nalezeny jako ..., které potlačovaly účinek jiných mutací
    supresorové mutace

    příklad: mutace tRNA, které suprimují mutace amber způsobující terminaci řetězce v UAG

    Image Upload 20


    Image Upload 21

    Image Upload 22
  32. některé supresorové mutace mění antikodóny tRNA tak, že mutantní tRNA reagují na terminační kodóny; na místo terminace translace tak dochází k...
    začleňování aminokyselin do polypeptidů
  33. vyjmenuj Iniciační a terminační kodony:
    • - iniciační: AUG
    • - terminační: UAA, UAG, UGA
    • téměř univerzální (výjimky- mitochondrie a někteří prvoci)
    • Image Upload 23
  34. čím je určena každá z 20AK v proteinech?
    je určena jedním nebo několika nukleotidovými triplety v mRNA
  35. kód je nepřekrývající (každý nukleotid patří k jedinému kodónu), degenerovaný, tz. že ...
    • většina AK je určena 2-4 kodóny
    • Image Upload 24
Author
iren
ID
346920
Card Set
05b TRANSLACE faze
Description
molekularni biologie
Updated